Železnice Slovenskej republiky sú na základe zákona NR SR č.258/1993 Z.z. v znení neskorších predpisov samostatnou právnickou osobou, zapísanou v Obchodnom registri.
Pri organizačnom usporiadaní ŽSR sa uplatňuje zásada dvojúrovňového riadenia:
- generálne riaditeľstvo,
- vnútorné organizačné jednotky (VOJ) zapísané a nezapísané v Obchodnom registri.
Štruktúru ŽSR tvoria vnútorné organizačné jednotky (VOJ) ŽSR.
